学校以研究生和本科生培养为主。设有七年制临床医学、口腔医学；五年制临床医学、口腔医学、空军临床医学、生物医学工程、预防医学（营养与食品卫生）、临床医学（康复医学与疗养学）；四年制药物制剂、公共事业管理（卫生统计）等10个本科专业；临床医学、口腔医学、口腔技工工艺、护理学4个大专专业。另有委托培养专业：两年制临床医学（专升本），口腔医学（专升本）；三年制临床医学大专，口腔医学大专；函授本科专业：生物医学工程，医学实验技术，公共事业管理，护理学，预防医学，药物制剂；夜大学：临床医学专业。还担负全军医务干部定期轮训。
　　 第四军医大学是国家首批博士、硕士学位授权单位。学校现有基础医学、口腔医学、生物医学工程、生物学等6个博士学位授权一级学科，博士学位授权二级学科47个，硕士学位授权二级学科62个。
　　 按照国家《授予博士、硕士学位和培养研究生的学科、专业目录》，学校学科涉及6个门类，21个一级学科。其中一级分别是：哲学、理论经济学、政治学、教育学、心理学、外国语言文学、数学、科学技术史、生物学、计算机科学与技术、生物医学工程、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、军队指挥学、军事后勤学与军事装备学、公共管理、图书馆情报与档案管理。（超级链接到二级学科以及相关科室）

2．学科情况

　　我校目前具有150多个科室（教研室）。现有基础医学、临床医学、生物学、口腔医学、公共卫生与预防医学、生物医学工程等7个博士后流动站；其中国家级重点学科13个（2007年全部通过国家考核评估），国家重点实验室1个，是西北地区唯一的生物医学领域国家重点实验室；还有全军医学专科中心17个，全军医学研究所13个，全军重点实验室12个。有8个“十五”“211工程”重点学科建设项目，12个“长江学者奖励计划”特聘教授岗位学科，硕士学位二级授权学科62个，博士学位二级授权学科47个，全军重点建设学科1个，全军重点建设实验室1个，军队“2110工程”重点建设学科领域3个。此外，还有两个国家临床药理基地、1个全军临床药理基地，另设中国癌症基金会肿瘤研究所及国家“８６３”西安细胞工程中心。国家级重点学科数量在全军院校中最多，全军医学研究所、医学专科中心数量、全军医学重点实验室数量在全军医科院校中最多。